一是土壤湿度
施用生物菌肥后一定要注意合理浇水，最好选择晴天上午浇小水，这样不仅能提高地温，还能通过放风排湿。注意浇水后最好要进行划锄，以此来增加土壤通透性，利于生物菌发挥效果。
二是土壤温度
据了解，生物菌肥中的生物菌一般在土壤18℃——25℃时生命活动最活跃，0℃以下时生命活动开始降低，这就需要首先控制好棚内的气温，以气温促地温回升。
一般棚内气温白天应保持在25℃——30℃为宜，夜间棚内温度低，为避免地温散失，维持地温恒定，除了采取地膜覆盖外，可在操作行内覆盖作物秸秆。
三是土壤酸碱度
资料表明：土壤pH值在6.5——7.5之间时最适合生物菌的繁殖，菜农可根据自己土壤的情况进行改造，让土壤pH值达到6.5——7.5，保证生物菌大量繁殖。
此外，菌肥主要靠分解土壤中的有机质生存繁殖并转化营养。因此，菌肥可配合有机肥使用。
