微生物的生命活动，除了会分解土壤中难溶及被固定的元素，增加营养元素的供应量，利用自然界的物质转化为植物生长所必须的物质，促进作物产量提高外，还能产生植物生长刺激素和拮抗某些致病微生物的作用，可减轻作物病虫害的发生，肥料效果的发挥与微生物菌群繁殖速度、菌群数量关系紧密，菌群生长存在周期，需要时间 。

　　见效慢并不意味着微生物菌肥是无效果的，能在较短时间内就可以看到作物长势明显改善的品种也未必一定是好的。

　　要相信微生物菌肥的解药害、抗重茬、改良盐碱、改善土壤生态环境等功效是很显著的，因为微生物菌肥是根据土壤微生态原理，植物营养学原理、以及现代“有机农业”的基本概念而研制出来的，是纯天然、无毒、无害、无污染的。